Žaidimo serija išgarsėjo ne tik dėl novatoriškos tuo metu siužeto linijos, bet ir dėl „papildymų“ (augmentations), kuriuos žaidėjas įvedęs į herojaus kūną, galėjo padidinti protagonisto sugebėjimus. Deus Ex: Human Revolution augmentations buvo suskirstyti į kelis tipus Kovos, sėlinimo, technologijos ir socialinių reikalų. Naudojant socialinių įgūdžių, ir stealth augmentations žaidėjas gali žaisti per visą žaidimą nežudydamas ir tik žudydamas žaidimo bosus.
Skirtingai nuo ankstesnių šios serijos žaidimų, Human Revolution bus naudojamas regeneruojamas sveikatos modelis. Šis pakeitimas buvo padarytas dėl to, kad kūrėjai nenorėjo žaidėjams patekti į padėtį, kai jie negalėjo progresuoti su herojumi dėl mažo sveikatos lygio. Kūrėjai tiki, kad jų regeneruoti sveikatos modelis paskatintais taktines ir strategines žaidėjo veiksmų naujoves. Kitas svarbus pakeitimas vertinti Deus Ex: Human Revolution yra išryškinti objektų sąveikavimas.